Nợ công là gì? Các công bố khoa học về Nợ công

Các dự án giải trình tự DNA thế hệ tiếp theo (NGS), chẳng hạn như Dự án Bộ Gen 1000, đã và đang cách mạng hóa sự hiểu biết của chúng ta về sự biến dị di truyền giữa các cá nhân. Tuy nhiên, các tập dữ liệu khổng lồ được tạo ra bởi NGS—chỉ riêng dự án thí điểm Bộ Gen 1000 đã bao gồm gần năm terabase—làm cho việc viết các công cụ phân tích giàu tính năng, hiệu quả và đáng tin cậy trở nên khó khăn ngay cả đối với những cá nhân có kiến thức tính toán phức tạp. Thực tế, nhiều chuyên gia gặp phải giới hạn về quy mô và sự dễ dàng trong việc trả lời các câu hỏi khoa học bởi sự phức tạp trong việc truy cập và xử lý dữ liệu do những máy này tạo ra. Trong bài báo này, chúng tôi thảo luận về Bộ công cụ Phân tích Bộ Gen (GATK) của chúng tôi, một khung lập trình có cấu trúc được thiết kế để tạo điều kiện thuận lợi cho sự phát triển của các công cụ phân tích hiệu quả và đáng tin cậy dành cho các máy giải trình tự DNA thế hệ tiếp theo sử dụng triết lý lập trình hàm MapReduce. GATK cung cấp một bộ mẫu truy cập dữ liệu nhỏ nhưng phong phú, bao trùm hầu hết các nhu cầu của công cụ phân tích. Việc tách biệt các tính toán phân tích cụ thể khỏi hạ tầng quản lý dữ liệu chung cho phép chúng tôi tối ưu hóa khung GATK về độ chính xác, độ ổn định, và hiệu quả CPU và bộ nhớ, cũng như cho phép phân giải song song bộ nhớ chia sẻ và phân tán. Chúng tôi nhấn mạnh các khả năng của GATK bằng cách mô tả việc triển khai và ứng dụng các công cụ đáng tin cậy và dung nạp quy mô như máy tính phủ và gọi đa hình đơn nucleotide (SNP). Chúng tôi kết luận rằng khung lập trình GATK cho phép các nhà phát triển và nhà phân tích nhanh chóng và dễ dàng viết các công cụ NGS hiệu quả và đáng tin cậy, nhiều công cụ trong số đó đã được tích hợp vào các dự án giải trình tự quy mô lớn như Dự án Bộ Gen 1000 và Atlas Bộ Gen Ung thư.

Cổng thông tin cBio Genomics về ung thư (http://cbioportal.org) là một nguồn tài nguyên truy cập mở để khám phá tương tác các bộ dữ liệu genomics ung thư đa chiều, hiện đang cung cấp truy cập tới dữ liệu từ hơn 5.000 mẫu khối u thuộc 20 nghiên cứu về ung thư. Cổng thông tin cBio Genomics về ung thư giảm đáng kể rào cản giữa dữ liệu genomics phức tạp và các nhà nghiên cứu ung thư, những người muốn tiếp cận nhanh chóng, trực quan và chất lượng cao với các hồ sơ phân tử và thuộc tính lâm sàng từ các dự án genomics ung thư quy mô lớn và giúp các nhà nghiên cứu chuyển đổi các bộ dữ liệu phong phú này thành các hiểu biết sinh học và ứng dụng lâm sàng. Cancer Discov; 2(5); 401–4. ©2012 AACR.

Làm thế nào chúng ta nên hiểu tại sao doanh nghiệp tồn tại? Một quan điểm phổ biến đã cho rằng chúng nhằm kiểm soát chi phí giao dịch phát sinh từ động lực tự lợi của cá nhân. Trong bài viết này, chúng tôi phát triển luận điểm rằng điều mà doanh nghiệp làm tốt hơn thị trường là chia sẻ và chuyển tải kiến thức của cá nhân và nhóm trong một tổ chức. Kiến thức này bao gồm thông tin (ví dụ: ai biết cái gì) và kỹ năng (ví dụ: làm thế nào để tổ chức một nhóm nghiên cứu). Điều cốt lõi trong luận điểm của chúng tôi là kiến thức được giữ bởi cá nhân, nhưng cũng được biểu hiện qua quy luật mà các thành viên hợp tác trong một cộng đồng xã hội (tức là nhóm, tổ chức, hoặc mạng lưới). Nếu kiến thức chỉ được giữ ở cấp độ cá nhân, thì doanh nghiệp có thể thay đổi chỉ bằng việc thay đổi nhân viên. Bởi vì chúng ta biết rằng thuê nhân sự mới không tương đương với việc thay đổi kỹ năng của doanh nghiệp, việc phân tích những gì doanh nghiệp có thể làm phải hiểu biết kiến thức như là nhúng trong nguyên tắc tổ chức mà con người hợp tác trong các tổ chức.

Dựa trên thảo luận này, một nghịch lý được xác định: những nỗ lực của doanh nghiệp để mở rộng bằng cách nhân bản công nghệ của mình tăng cường khả năng bắt chước. Bằng cách xem xét làm thế nào doanh nghiệp có thể ngăn chặn bắt chước bằng sự sáng tạo, chúng tôi phát triển một cái nhìn năng động hơn về cách các doanh nghiệp tạo ra kiến thức mới. Chúng tôi xây dựng quan điểm năng động này bằng cách đề xuất rằng doanh nghiệp học những kỹ năng mới bằng cách kết hợp lại các khả năng hiện có của mình. Bởi vì các cách hợp tác mới không dễ dàng được thu nhận, sự tăng trưởng xảy ra bằng cách xây dựng trên các mối quan hệ xã hội hiện có trong một doanh nghiệp. Những gì một doanh nghiệp đã làm trước đây có xu hướng dự đoán những gì nó có thể làm trong tương lai. Theo nghĩa này, kiến thức tích luỹ của doanh nghiệp cung cấp các lựa chọn để mở rộng vào các thị trường mới nhưng không chắc chắn trong tương lai.

Chúng tôi thảo luận chi tiết ví dụ về quyết định sản xuất/mua và đề xuất một số giả thuyết có thể kiểm chứng về ranh giới của doanh nghiệp, mà không cần viện đến khái niệm "cơ hội."

Các nghiên cứu dân tộc học gần đây về thực tiễn nơi làm việc chỉ ra rằng cách mọi người thực sự làm việc thường khác biệt cơ bản so với cách các tổ chức mô tả công việc đó trong các hướng dẫn, chương trình đào tạo, sơ đồ tổ chức và mô tả công việc. Tuy nhiên, các tổ chức có xu hướng dựa vào những mô tả này trong nỗ lực hiểu và cải thiện thực tiễn công việc. Chúng tôi nghiên cứu một trong những nghiên cứu như vậy. Sau đó, chúng tôi liên hệ kết luận của nó với các nghiên cứu tương thích về học tập và đổi mới để lập luận rằng các mô tả thông thường về công việc không chỉ che giấu cách mọi người làm việc, mà còn che giấu sự học và đổi mới đáng kể được tạo ra trong các cộng đồng thực hành phi chính thức nơi họ làm việc. Bằng cách đánh giá lại công việc, học tập và đổi mới trong bối cảnh các cộng đồng và thực hành thực tế, chúng tôi gợi ý rằng các kết nối giữa ba yếu tố này trở nên rõ ràng. Với một cái nhìn thống nhất về làm việc, học tập và đổi mới, cần có khả năng tái định nghĩa và tái thiết kế các tổ chức để cải thiện cả ba yếu tố này.

Trong công trình này, chúng tôi mô tả ngắn gọn những đặc điểm nổi bật nhất của WSXM, một phần mềm miễn phí cho viển thám hiển vi dựa trên hệ điều hành MS-Windows. Bài báo được cấu trúc thành ba phần khác nhau: Phần giới thiệu là một cái nhìn tổng quan về tầm quan trọng của phần mềm trong viển thám hiển vi. Phần thứ hai được dành riêng để mô tả cấu trúc tổng quát của ứng dụng; trong phần này, những khả năng của WSXM để đọc các tệp bên thứ ba được nhấn mạnh. Cuối cùng, một cuộc thảo luận chi tiết về một số quy trình quan trọng của phần mềm được thực hiện.

Đặt vấn đề:  Do những khó khăn phương pháp học cụ thể trong việc tiến hành các thử nghiệm ngẫu nhiên, nghiên cứu phẫu thuật chủ yếu phụ thuộc vào các nghiên cứu quan sát hoặc không ngẫu nhiên. Chỉ có một ít công cụ đã được xác thực để xác định chất lượng phương pháp luận của các nghiên cứu này, cả từ góc độ của người đọc lẫn nhằm mục đích tổng hợp phân tích. Mục tiêu của nghiên cứu hiện tại là phát triển và xác thực một công cụ như vậy.

Phương pháp:  Sau giai đoạn khái niệm ban đầu về một chỉ số phương pháp luận cho các nghiên cứu không ngẫu nhiên (MINORS), danh sách 12 mục tiềm năng đã được gửi đến 100 chuyên gia từ các chuyên khoa phẫu thuật khác nhau để đánh giá, và cũng được 10 chuyên gia về phương pháp lâm sàng đánh giá. Việc kiểm tra tiếp theo liên quan đến việc đánh giá mức độ đồng thuận giữa các người đánh giá, độ tin cậy của bài kiểm tra chéo tại 2 tháng, độ tin cậy nhất quán nội bộ và độ xác thực bên ngoài.

Điều kiện thị trường không ổn định do đổi mới và sự gia tăng cường độ và đa dạng hoá cạnh tranh đã dẫn đến việc năng lực tổ chức thay vì phục vụ thị trường trở thành cơ sở chính để các công ty xây dựng chiến lược dài hạn của mình. Nếu tài nguyên chiến lược quan trọng nhất của công ty là tri thức, và nếu tri thức tồn tại dưới hình thức chuyên biệt giữa các thành viên trong tổ chức, thì bản chất của năng lực tổ chức là sự hội nhập tri thức chuyên môn của các cá nhân.

Bài viết này phát triển một lý thuyết dựa trên tri thức về năng lực tổ chức và dựa trên nghiên cứu về động lực cạnh tranh, quan điểm dựa trên tài nguyên của công ty, năng lực tổ chức và học hỏi tổ chức. Cốt lõi của lý thuyết là phân tích các cơ chế thông qua đó tri thức được hội nhập trong các công ty nhằm tạo dựng năng lực. Lý thuyết được sử dụng để khám phá tiềm năng của các công ty trong việc thiết lập lợi thế cạnh tranh trong các thị trường động, bao gồm vai trò của mạng lưới công ty dưới điều kiện liên kết không ổn định giữa đầu vào tri thức và đầu ra sản phẩm. Phân tích chỉ ra những khó khăn trong việc tạo ra “năng lực phản ứng linh hoạt và động” đã được xem là trọng tâm để thành công trong thị trường cạnh tranh khốc liệt.

Đất được thu thập qua một thí nghiệm đã bón vôi lâu dài (pH 4.0–8.3), trong đó sự biến đổi của các yếu tố khác ngoài pH đã được giảm thiểu, được sử dụng để khảo sát ảnh hưởng trực tiếp của pH lên sự phong phú và thành phần của hai nhóm chính trong vi sinh vật đất: nấm và vi khuẩn. Chúng tôi giả thuyết rằng các cộng đồng vi khuẩn sẽ bị ảnh hưởng mạnh bởi pH hơn là các cộng đồng nấm. Để xác định tỷ lệ phong phú tương đối của vi khuẩn và nấm, chúng tôi đã sử dụng PCR định lượng (qPCR), và để phân tích thành phần và đa dạng của các cộng đồng vi khuẩn và nấm, chúng tôi đã sử dụng kỹ thuật tuần tự song song có mã vạch. Cả tỷ lệ phong phú tương đối và đa dạng của vi khuẩn đều có quan hệ dương với pH, trong đó tỷ lệ phong phú gần như tăng gấp đôi giữa pH 4 và 8. Trái lại, tỷ lệ phong phú tương đối của nấm không bị ảnh hưởng bởi pH và độ đa dạng của nấm chỉ có liên hệ yếu với pH. Thành phần của các cộng đồng vi khuẩn được xác định chặt chẽ bởi pH của đất; có sự biến đổi thành phần cộng đồng vi khuẩn dọc theo khoảng cách 180 mét của thí nghiệm này cũng như so với đất thu thập từ nhiều biôma khác nhau ở Bắc và Nam Mỹ, nhấn mạnh sự chi phối của pH trong việc cấu trúc các cộng đồng vi khuẩn. Ảnh hưởng trực tiếp rõ ràng của pH lên thành phần của cộng đồng vi khuẩn có lẽ do phạm vi pH hẹp cho sự phát triển tối ưu của vi khuẩn. Thành phần cộng đồng nấm ít bị ảnh hưởng bởi pH hơn, điều này phù hợp với các nghiên cứu văn hóa thuần túy, cho thấy nấm thường có các phạm vi pH rộng hơn cho sự phát triển tối ưu.